Los Hammams (baños de vapor) están construidos en el subsuelo del patio de la mezquita, en un área de 6 000 m². Están diseñados para alojar a 1 400 personas separadas también entre mujeres y hombres. Se llega por una gran escalera decorada con columnas de mármol verde y frisos finamente incrustados de Zellige.
 
Desde la sala de recepción se llega a una serie de hammams y de columnas que conducen a los vestuarios. Cada hammam consiste, en la pura tradición marroquí, de tres habitaciones contiguas, cada una cubierta por una cúpula calada y revestida de marga.

Una parte del Hammam cuenta en piscinas climatizadas para mujeres y para hombres, como baños terapéuticos.